Fusarium oxysporum F.Sp. melonis ırklarının daf (Dna Amplifıcation Fingerprinting) metoduyla belirlenmesi

Abstract

FÜSARIUM QXYSPORUM F.SP. MELONIS IRKZAJUNIN DAF (DNA AMPLIFICATION FINGERPRINTING) METODUYLA BELİRLENMESİ Kader YA?IZ Yüksek Lisans Tezi " Biyoloji Aüabilim Dalı Haziran 1995, 44 Sayfa Fusarium oxysporum f.gp.melonis'in kavunlarda neden olduğu solgunluk ve sararma hastalıkları, dünya kavun üretiminin önemli sorunlarıdır. Bu patojeninin dört farklı ırkı (0,1,2 ve 1.2) taşıyıcılarında oluşturdukları hastalıklar temel alınarak tanımlanmağına rağmen, moleküler işaretleyiciler halen ırkların ayırımında güvenilir olarak imkan sağlayacak kadar elverişli değildir. Bu çalışmanın amaçlan ırka özel olan PCR'a bağlı DAF işaretleyicilerini tanımlamak ve ırklar arasındaki genetik ilişkiyi belirlemekti. îki set olan ırkların (bir set Fransa'dan ve diğeri Amerika Birleşik Devletleri'nden) spor kültürlerinden elde edilen genomik DNA, özel bir sekansa sahip olmayan S-mer ya da 10-merlık primerlerie çoğaltıldı. Bazı çoğaltma ürünleri restriksiyon enzimleriyle de kesildi. DAF sonucu oluşan bantlar poliakrilamid jel elektrofbrez ve gümüş boyama ile belirlendi. Test edilen 40 primerden 14 tanesi özel DAF bantları meydana getirdi, Irklar arasındaki Jaecard' in benzerlik katsayısı 0,38 ( Irk 2- Irk 1,2) ile 0.64 (Irk 0- Irki) arasındaydı. Seçilen 14 primerin meydana getirdiği bantların kullanılmasıyla oluşan sınıf analizi, iki farklı sınıf oluşturdu (Irk 2 ve diğerleri). Elde ettiğimiz sonuçlar DAF metodunun, Fusarium oxysporum f.sp.melonis ırklarının ayırımında olduğu gibi ırklar arasındaki genetik ilişkinin belirlenmesinde de kullanılabilecek kadar basit, hızlı ve güvenilir olduğunu gösterdi.